Nueva edición de Biologia molecular para programadores
Biología Molecular para programadores Clases en
auditorio.
Fundamentos y herramientas de Biología Molecular esenciales para trabajar en Bioinformática.
Objetivos: Incorporar los conocimientos básicos de biología molecular útiles para trabajar en bioinformática, desarrollar aplicaciones especializadas o dar soporte informático a biólogos moleculares, biotecnólogos, bioquímicos y médicos
Inicio: Se dictará lunes de 18.30 a 21.30 hs. desde el 28 de septiembre de 2009
Duración: 15 horas, en cinco clases de 3 hs cada una.
Costo: $180
Mas información en la página del
Club de programadores.
Etiquetas: biologia, biopython, python
GenesDigitales presenta una nueva versión de DNALinux, Virtual Desktop Python for Bioinformatics Edition. DNALinux Py4Bio es una máquina virtual con la distribución Linux Xubuntu y software de bioinformática preinstalado. Esta versión de DNALinux formará parte del libro "
Python for Bioinformatics" Todo el software explicado en el libro esta incluido en esta versión de DNALinux Virtual Desktop como asi tambien software especifico de bioinformatica. Los programas bioinformáticos incluidos mas destacados son: Biopython, BLAST, Emboss, NCBI toolkit y otros. La lista completa está disponible en
http://www.dnalinux.com/installedsoftware.htmlEsta versión reemplaza a la linea "desktop" y "server" ya que tiene ambos tipos de programas. Con DNALinux es posible montar un servidor BLAST sin necesidad de configurar Apache y CGI porque ya viene preconfigurado y listo para usar.
DNALinux está compuesto por una "distro base" (Xubuntu 8.04) corriendo sobre una maquina virtual (VMWare). La principal ventaja de esta configuración es que su la virtualización no afecta el sistema operativo ya instalado, permitiendo el aprendizaje, testeo y desarrollo de aplicaciones bioinformáticas en un ambiente uniforme.
La maquina virtual tiene un tamaño de mas de 12 Gb, aunque se distribuye comprimida con 7zip en un archivo de 2.3Gb. La distribución se realiza con el protocolo bittorrent, motivo por el cual solicitamos a los usuarios que estén en condiciones de "seedear" la imagen el
mayor tiempo posible.
Para citarlo por si se lo usa en alguna publicación:
Bassi, Sebastian and Gonzalez, Virginia. DNALinux Virtual Desktop Edition. Available from Nature Precedings <http://dx.doi.org/10.1038/npre.2007.670.1> (2007)Etiquetas: biopython, dnalinux, geek
Como parte del evento
Ciclo de charlas UNLUX 2008 : "Integrando Disciplinas", daré una charla llamada "Aplicaciones de Python en la Biología Molecular".
La idea es mostrarle a los biologos, biotecnologos y otros profesionales del ramo, que es Python y como puede aplicarse para resolver problemas biologicos. Tambien puede ir cualquier que tengo curiosidad por el tema, aunque los biologos podrán sacarle mas provecho a la charla. Cuando la tenga terminada pondré la presentación aca.
Por lo pronto este es el programa (para mas info
vean la página de UNLUX):
Cronograma de charlas
| Aula A | Aula 202 | Aula 203 | Auditorio | Aula de PC |
|
| 10:00:00 |
|
|
|
|
|
|
| 10:30:00 |
|
| "Entendiendo UNICODE" Facundo Batista | Primeros pasos "¿Qué es el software libre?" Maria Elena Casañas |
|
|
| 11:00:00 |
| "Arte, animación y diseño con Software Libre" Franco Iacomella |
|
|
| 11:30:00 |
|
|
|
|
|
| 12:00:00 | "Amenazas y oportunidades que la ciencia y la tecnología nos deparan para el futuro" Javier Blanque | "Diseño web con herramientas libres" Diego Accorinti |
| "Introducción al Lenguaje Python" Facundo Batista | Taller de OpenOffice: "Introducción a herramientas ofimáticas libres" Ariel Condo |
|
| 12:30:00 |
|
|
| 13:00:00 | INTERVALO DE ALMUERZO |
|
| 13:30:00 |
|
| 14:00:00 |
| "Firefox y el Software Libre" Santiago Hollmann |
| Primeros pasos "Cómo migrar" Maria Elena Casañas | Seguridad Informática: "Estrategia, ataque y defensa" Facundo M. de la Cruz |
|
| 14:30:00 | Aplicaciones de Python en la Biología Molecular Sebastian Bassi |
|
|
| 15:00:00 | "Moodle: Administrador de Contenidos educativos (LMS)" Carlos Javier Di Salvo |
|
|
|
| 15:30:00 |
|
| "Herramientas de Software Libre para enseñar matemática" Pablo De Napoli |
|
| 16:00:00 | "8000000000000u$s en desarrollo, 350 millones de líneas de código y 70.000 años/hombre: Debian" Dererk |
|
|
|
|
| 16:30:00 |
|
|
|
|
|
| 17:00:00 | Debate: "Trabajo Independiente / Freelance vs. Trabajo en relación de dependencia" |
|
|
| 17:30:00 |
|
|
| 18:00:00 |
|
|
|
|
|
|
| 18:30:00 |
|
|
|
|
|
|
Etiquetas: biologia, biopython, biotec, python
