Prueba, no molestar!
Probando meter codigo, si funciona pondré algo coherente (o al menos lo intentaré).
from __future__ import with_statement
from Bio import SeqIO, SeqRecord, Seq
#para planillas html de Laura
ain='/mnt/hda2/bio/cln.txt'
cln=set()
with open(ain) as f:
for line in f:
cln.add(line[:-1])
#print line,
#sco esas del fasta y las pongo en otro fasta.
#recorro el fasta
i = 0
fasta69 = []
for record in SeqIO.parse(open('/mnt/hda2/bio/bacs.v247.seq'), "fasta") :
if record.id in cln:
fasta69.append(record)
with open('/mnt/hda2/bio/fasta69.txt','w') as outf:
SeqIO.write(fasta69,outf,"fasta")
Etiquetas: python, test
2 Comentarios:
Con colorcitos y todo, hasta en planeta pyar :-)
Sip, quedo mejor de lo que pensaba. Aguante el Kate! :)
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